1996年,怪兽伊比**陆东京,摩杰拉mii型应战,成功击杀。
1998年,人类为哥斯拉建立了研究所,哥斯拉二世的活动被限制在终焉岛,人类暂时告别了哥斯拉的威胁。
1999年,外星生物奥加入侵,与摩杰拉mii型大战,摩杰拉被毁。
2000年,奥加尚存,持续寻找哥斯拉的信息,人类军事武器对其完全无效。
2002年,三式作战型超级机械哥斯拉问世,成功击溃奥加。战役中三枝未希受重伤。
2004年,哥斯拉二世体型已经超过一百米,已然成为继平成哥斯拉后又一个怪兽王。
2009年,负责照顾哥斯拉的五条不幸因病身亡。
同年,又出现一只新的碧奥兰蒂和哥斯拉,分别取代号晴生、暗黑破坏神。双方大战,最终哥斯拉胜。
2010年,科学家确定,1989年的碧奥兰蒂死后,少部分细胞残留在地球,很有可能发育为碧奥兰蒂或者受变异发育为其他怪兽,诸如暗黑破坏神哥斯拉。
2011年,人类再一次掌握微小氧气的使用手段,终结了暗黑破坏神哥斯拉。
2012年,人类发现并回收了大部分的碧奥兰蒂细胞,但依旧有很多细胞留在野外。
2014年,受g细胞的核辐射影响,怪兽穆托苏醒。
2019年,哥斯拉突破终焉岛的防护,再次回归野外。
2022年,两只穆托成年体步入人类城市计划进行交配。
动物行为学家克林顿·华纳向美国国防部提议,认为穆托很可能会去往一些人流量少、隐蔽的地区产卵,而热带雨林就是最佳的产卵地。美方在收到克林顿的提议后组建了热带雨林防卫联合组织。中国、印度和一些非洲国家参与了组织。
然而,日本表现出极端的不服从态度。对此问题,日本表示,比起穆托,哥斯拉更可能带来巨大威胁。美方的专家认为日本过多受到哥斯拉影响,处在一种过度的恐慌的状态中,哥斯拉逃离终焉岛时,科研团队已经掌握了哥斯拉的各种弱点,就算目前人类研发的机械无法战胜哥斯拉,人类还有最后的手段——氧气破坏者。双方并没有展开激烈争斗,在目前看来,无论是哥斯拉还是穆托,都是巨大威胁,如果单纯在嘴皮子上下功夫,实在荒唐。
与此同时,俄罗斯成立了g细胞搜查小队,全面搜查残留的碧奥兰蒂细胞。由于受到全人类的支持,g细胞搜查小队成员可以任意来访任何国家。日本的科学院博士家诚猪四郎大力支持俄罗斯的搜查队,并不断给予他们技术、理论支持。
同时,作为大受哥斯拉影响的国家,日本此刻的g作战措施已经发展到了极致。数架superx战机陈列在了国防部;除此之外,机械哥斯拉被一再翻新,目前已经配备史上最强的军事武器——绝对零度炮,一种威力足够彻底粉碎三座大楼的强力武器;机械哥斯拉的辅助机械,摩杰拉也得到加强,现在可以像机械哥斯拉一样无视哥斯拉热线的攻击。
在哥斯拉逃离终焉岛后,从未再次登陆,甚至没有人再次发现过哥斯拉的踪迹。而此刻,美方已经布置好了非洲的战线,所有力量集中在了对穆托的战斗中,丝毫没有考虑哥斯拉的突然影响。